谷物冷却机的工作，除了受客观环境限制影响正常使用外，还取决于操作人员的工作经验。有时出现的问题，并非操作人员的错误，因为在较早的国家标准，企业的使用说明书中，都是笼统的注明：谷物冷却机的适用工况为：-10℃—43℃。在这种情况下，有些粮库的操作者，想当然的随意设定出风的温度和湿度，而且不管当时的环境温度、湿度，是否适宜设备工作，强行开机，由此造成许多意外的故障出现。
环温高，湿度大，一般的通风风机同样无法使用，此时使用谷物冷却机，来给仓粮降温除湿正当其实，制冷压缩机应该全部开启，尤为关键的是操作方法，即：出风口的温度、湿度设定值。此时设置是否合理，直接关系到降温效果和时间的长短。有些人将温度设定为T=8，相对湿度为R=50%，这样的设置对设备运行不利，通常会造成蒸发器接霜，压缩机接霜的情况出现，长时间还会出现停机的现象。
干燥的湿物料由皮带输送机或斗式提升机送到料斗，然后经料斗的加料机通过加料管道进入加料端。加料管道的斜度要大于物料的自然倾角，以便物料顺利流入冷却器内。冷却器圆筒是一个与水平线略成倾斜的旋转圆筒。物料从较高一端加入，载热体由低端流出，与物料成逆流接触，也有载热体和物料一起并流进入筒体的。随着圆筒的转动物料受重力作用运行到较底的一端。湿物料在筒体内向前移动过程中，直接或间接得到了载热体的给热，使热物料得以冷却，然后在出料端经皮带机或螺旋输送机送出。在筒体内壁上装有抄板，它的作用是把物料抄起来又撒下，使物料与气流的接触表面增大，以提高冷却速率并促进物料前进。冷却体一般分为冷空气等。载热体经冷却器以后，一般需要旋风除尘器将气体内所带物料捕集下来。如需进一步减少尾气含尘量，还应经过袋式除尘器或湿法除尘器后再放排放。