有机硅憎水剂通常具有良好的透明性，不改变物体的外观和质感。这使得它可以广泛应用于多种需要保持原貌的物体，如玻璃、塑料等；有机硅憎水剂具有防水保护、憎水效果、耐久性、透明性和多功能性等多种好处，使其成为一种重要的涂层材料。
用于瓷砖等饰面接缝上，因其吸水率低，冬天存水结冰，产生膨胀，可防止瓷砖等的剥落，用于天然石料上，能防止青苔生长，保持表面清洁。
有机硅树脂具有低表面张力这一特性，因其化学成分聚硅氧烷的内聚能密度低，这导致了分子之间作用力小，分子处于高柔顺状态。而聚硅氧烷的特性是溶解度远低于多数化合物，所以也导致了有机硅树脂不易与其他物质相容。