高企认证的流程通常是： 1、企业申请，企业对照本办法进行自我评价。认为符合认定条件的在“高新技术企业认定管理工作网”注册登记，向认定机构提出认定申请。 2、评审，认定机构应在符合评审要求的中，随机抽取组成组。组对企业申报材料进行评审，提出评审意见。 3、审查认定，认定机构结合组评审意见，对申请企业进行综合审查，提出认定意见并报领导小组办公室。
高新技术企业认定部门一般是科技部、财政部、税务总局负责全国高新技术企业认定工作的指导、管理和监督。各省、自治区、直辖市、计划单列市科技行政管理部门同本级财政、税务部门组成本地区高新技术企业认定管理机构。认定机构下设办公室，由省级、计划单列市科技、财政、税务部门相关人员组成，办公室设在省级、计划单列市科技行政主管部门。
进行高企认证的企业的创新主要是自主创新，其特点为自主技术创新不可能在技术的每一个环节上都是创新的，但其中的核心技术或主导技术是由企业依靠自身力量立研究开发而获得的，这是“自主”的含义所在。目标具有率先性，自主创新的技术成果具有占性。知识和能力的支持是创新成功的内在基础和必要条件。自主开发技术的创新模式，主要用于全新创新或重大的突破性技术创新，它需要有很大研究与发展的投入，有较雄厚的技术力量，并有较多的技术积累。在竞争中取得地位时，采取这种模式。
自主创新所具有的优点对高技术企业成长具有重要的意义。一是给予自主创新者的技术垄断地位和保护，自主创新在技术方面就具有了较强的壁垒。二是由于跟进者对新技术的解密、消化、模仿需要一定的时间，发展成为较强的竞争者也需要一定的过程，因此，自主创新企业能在一定时期内占某项产品或工艺的核心技术，使自己在竞争中处于有利地位。
高企认证企业的知识产权通过自主研发、受让、受赠、并购等方式，获得对其主要产品（服务）在技术上发挥核心支持作用的知识产权的所有权；专利有效；知识产权权属人为申请企业；多个权属人的申请高新技术企业及高新技术企业资格存续期内，只能由一个权属人在申请时使用；Ⅱ类专利只能使用一次。
高新技书企业认定对知识产权要求： （一）认定所指的知识产权须在中国境内授权或审批审定，并在中国法律的有效保护期内。知识产权权属人应为申请企业，即使是企业法人代表的个人专利也要办理专利转让手续； （二）认定中，对企业知识产权情况采用分类评价方式，其中：发明专利（含专利）、植物新品种、农作物品种、国家新药、国家保护品种、集成电路布图设计专有权等按Ⅰ类评价；实用新型专利、外观设计专利、软件著作权等（不含商标）按Ⅱ类评价； （三）按Ⅰ类评价的知识产权在申请时，不限使用次数；按Ⅱ类评价的知识产权在申请时，使用一次； （四）在申请及存续期内，知识产权有多个权属人时，只能由一个权属人在申请时使用，其他权属人明确申明放弃使用； （五）申请认定时专利的有效性以企业申请认定前获得授权证书或授权通知书并能提供缴费收据为准； （六）不具备知识产权的企业不能认定为； （七）无证书的专利须拥有授权通知书，且有缴费单据； （八）非的专利，通过受让、受赠、并购等方式获得的知识产权，办理转让手续，经过专利备案，或有国家知识产权局出具的所有权转让； （九）企业的主要产品（服务）与知识产权相关联； （十）企业更名的应提供工商更名，以判断知识产权归属。
认定的标准解析 一、到天数的年限要求 企业注册成立365个日历天数以上;“当年”、“近一年”和“近一年”都是指企业申报前1个会计年度;“近三个会计年度”是指企业申报前的连续3个会计年度(不含申报年);“申请认定年内”是指申请前的365天之内(含申报年)。 二、主要产品(服务)核心技术的领域要求 1、对企要产品(服务)发挥核心支持作用的技术属于《国家支持的高新技术领域》规定的范围; 2、主要产品(服务)是指其收入之和在企业同期高新技术产品(服务)收入中超过50%的产品(服务)。事实上有利于知识产权“核心支持作用”的认定。 三、高新技术产品(服务)收入占比的要求 企业研究开发费用占比是企业近三个会计年度(实际经营期不满三年的按实际经营时间计算)的研究开发费用总额占同期销售收入总额的比值。即三年研发费用总额除以三年销售收入总额的比例，只要这个比例不低于规定比例，就符合条件《管理办法》要求:近一年销售收入小于5,000万元(含)的企业，比例不低于5%;近一年销售收入在5,000万元至2亿元(含)的企业，比例不低于4%;近一年销售收入在2亿元以上的企业，比例不低于3%。其中，企业在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例不低于60%; 销售收入为主营业务收入与其他业务收入之和。主营业务收入与其他业务收入按照企业所得税纳税申报表的口径计算。 2、企业研究开发活动(研发项目)的确定 研发活动的确定方法与此前类似，包括行业标准判断法、判断法和目标或结果判定法。其中，目标或结果判定方法是前两种方式的方法。企业应按照研究开发活动的定义填写<<认定申请书>>中“四.企业研究开发活动情况表”。 3、研发费用的归集方法 企业应正确归集研发费用，由具有并符合《工作指引》相关条件的中介机构进行专项审计或鉴证。 企业的研究开发费用是以单个研发活动为基本单位分别进行测度并加总计数的。以单个研发活动为基本单位则省去了运用费用分摊机制的麻烦。企业应对包括直接研究开发活动和可以计入的间接研究开发活动所发生的费用进行归集，并填写《认定申请书》中的“企业年度研究开发费用结构明细表”。 企业应按照“企业年度研究开发费用结构明细表”设置认定研究开发费用核算账目，提供相关凭证及明细表，并按要求进行核算。 4、研发费用的归集范围 包括人员人工费用;直接投入费用;折旧费用及长期待摊费用;无形资产摊销费用;设计费用;装备调试费用与试验费用;委托外部研究开发费用和其他费用，其他费用为20%，包括技术图书资料费、资料翻译费、咨询费、高新科技研发保险费，研发成果的检索、论证、评审、、验收费用，知识产权的申请费、注册费、代理费，会议费、差旅费、通讯费等其他费用 六、企业无重大特别事项的要求 企业申请认定年内未发生重大安全、重大质量事故或严重环境违法行为。由认定机构自行查询企业是否存在“重大特别事项”。
固定资产折旧与长期待摊费用3.1难点 固定资产折旧与长期待摊费用摊销，是指为开展研究开发活动购置的仪器和设备以及研究开发项目在用建筑物的折旧费用，包括研究开发设施改建、改装、装修和修理过程中发生的长期待摊费用。3.2应对措施 a.检查固定资产明细账、长期待摊费用明细账；检查申报企业年度新增固定资产及长期待摊费用的、固定资产的申购单、入库单、验收单；实地查看该部分设备，核对资产用途（检查使用说明书等），确定其是否真实存在，是否用于研究开发项目。 b.结合固定资产盘点，核对与研究开发活动相关的固定资产是否账实相符；检查购入时已计入研究开发费用的固定资产，是否单管理，是否存在重复计提折旧的情况。 c.复核各项折旧、摊销的准确性及相关性，关注前后各期折旧政策及方法的一致性d.对属于多个项目使用的，检查分摊方法是否合理，且前后各期是否保持一致，分摊的金额是否正确。
高企认证是指中国对企业进行的一种认证体系，旨在推动企业的创新能力、竞争力和可持续发展能力的提升。高企认证通过对企业的综合评价，包括企业的技术创新、管理创新、质量管理、知识产权保护等方面的考核，评定企业是否具备高新技术企业的资格，并给予相应的政策支持和优惠政策。高企认证的标准和程序由中国科技部、财政部、国家税务总局等部门制定和管理，企业可以通过申请认证来获得相应的认可和支持。高企认证对企业的技术创新能力、管理能力和市场竞争力的提升起到了积极的推动作用，对促进企业的发展和推动经济的转型升级具有重要意义。