氧化钙忌与氮肥同时施用。生石灰遇水生成大量的OH-，使NH₄++OH-≒NH₃·H₂O平衡向右进行，氨水含量高易引起鱼类氨中毒。同理，池水中氨氮含量1.2毫克/升时，也不宜放用生石灰。另外施铵态氮肥后隔一周后方可使用生石灰，切忌混用。
氧化钙长时间在空气中暴露会吸收二氧化碳变成粉末状碳酸钙，起不到清塘消毒的作用。因此生石灰现买现用，且选择块状较轻、不含杂质的为好。若一次用不完剩下的生石灰用塑料袋扎口密封保存。
氧化钙不能和磷肥混用。施磷肥后无机磷在pH为6.5～7.5时主要以HPO₄2-、H₂PO₄-形式存在，若与生石灰混用在pH大于7.5时，会发生反应生成Ca（PO₄）₂，使有效磷易形成钙盐沉淀而损失。一般施生石灰后至少隔10～15天方可施磷肥。