专为运输要求保持一定温度的冷冻货或低温货而设计的集装箱。它分为带有冷冻机的内藏式机械冷藏集装箱和没有冷冻机的外置式机械冷藏集装箱。适用装载肉类、水果等货物。冷藏集装箱造价较高，营运费用较高，使用中应注意冷冻装置的技术状态及箱内货物所需的温度。
冷藏集装箱商品通常，冷藏货物可以分成两种：冷藏和冷冻
许多冷藏货物（例如水果）被视为是“活性（live）”货物，因为其在采摘过后仍然能够进行呼吸并且由于自热、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他条件而容易腐烂。
二手冷藏集装箱的冷藏制冷能力有限，主要用于保持货物温度。也就是说，人们把-20℃的货物装进去，它能保持货物在-20℃，安全地运送到目的地；人们把5℃的货物装进去，它能保持货物在5℃下安全地运送到目的地。如果把常温下（20℃）的货物，直接装箱并要求它冷冻到-20℃，将无法实现。因此，货物在装入二手冷藏集装箱之前需先降温到温度。