目前，医疗污水处理设备医疗废水的处理工艺，主要由沉淀消毒处理和二级生化消毒处理工艺。医疗污水处理设备具体处理工艺可根据出水要求进行选择。当处理废水可排入城市污水管网时，采用处理，要求直接排放时，采用二级处理工艺。
工艺特点 ：好氧生化处理单元去除CODcr、BOD5等有机污染物，好氧生化处理可选择接触氧化、活性污泥和好氧处理工艺，如膜生物反应器、曝气生物滤池等工艺。采用具有过滤功能的好氧处理工艺，可以降低悬浮物浓度，有利于后续消毒。
适用范围： 适用于传染病医院(包括带传染病房的综合医院)和排入自然水体的综合医院污水处理。
现代污水处理技术，按处理程度划分，可分为、二级和三级处理，一般根据水质状况和处理后的水的去向来确定污水处理程度。 处理主要去除污水中呈悬浮状态的固体污染物质，物理处理法大部分只能完成处理的要求。经过处理的污水，BOD一般可去除30%左右，达不到排放标准。处理属于二级处理的预处理。 二级处理主要去除污水中呈胶体和溶解状态的有机污染物质（BOD，COD物质），去除率可达90%以上，使有机污染物达到排放标准，悬浮物去除率达95%出水效果好。 三级处理进一步处理难降解的有机物、氮和磷等能够导致水体富营养化的可溶性无机物等。主要方法有生物脱氮除磷法，混凝沉淀法，砂滤法，活性炭吸附法，离子交换法和电渗析法等。