食品流通许可证，是对食品流通许可证的发放、发放条件、发放程序以及与食品卫生许可证的衔接等问题予以明确。
2014年10月23日，通过关于取消和调整一批行政审批项目等事项的决定（国发〔2014〕50号），改为后置审批，规定对食品经营者先照后证。
全国工商系统已累计核发食品流通许可证594.64万个，加上原已领取食品卫生许可证并仍在有效期内的食品经营者，全国持有“两证”的合法食品经营主体总计达到613.38万户。
直至2012年，通过严把食品经营准入关，我国食品经营主体素质有所提高，但仍然存在着总体数量较大，小、散、乱问题等问题。
申请人应当在申请书上签字盖章。新设食品流通经营企业申请许可，该企业的投资人为许可的申请人；已经具有主体资格的企业申请食品经营许可，该企业为申请人；个体工商户申请食品流通许可，本人为许可的申请人。
已经具有主体资格的经营者在经营项目中申请增加食品流通项目的，需提交营业执照副本原件及复印件，不需提交《名称预先核准通知书》复印件。对营业执照副本原件当场审验后退回。 [2]
变更
食品经营者注册公司改变许可事项，应当向原许可机关申请变更食品流通许可。未经许可，不得擅自改变许可事项。食品经营者向原许可机关申请变更食品流通许可的，应当提交下列申请材料：
《食品流通变更许可申请书》；
《食品流通许可证》正、副本；
与变更食品流通许可事项相关的材料。
食品流通许可的有效期为3年。食品经营者需要延续食品流通许可的有效期的，应当在《食品流通许可证》有效期届满三十日前向原许可机关提出申请，换发《食品流通许可证》。
办理许可证延续的，换发后的《食品流通许可证》编号不变，但发证年份按照实际情况填写，有效期重新计算。