科研院所申请进出口权须履行以下程序：各部门直属科研院所应向其主管部门提出书面申请，由主管部门送科技部和外经贸部
进出口权原则上直接赋予科研院所，不另外批准成立新的进出口公司。科研院所已有企业法人营业执照的，进出口权直接授予该单位；科研院所本身没有企业法人营业执照的．对外经营权可根据申请单位要求授予的一家直属全资全民所有制企业。
获得进出口经营权的供销合作社企业，其进出口业务的范围原则上与其经批准的国内业务经营范围相一致，但不经营国家组织统一联合经营的16种出口商品和国家实行核定公司经营的14种进口商品。