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人体、动物体内有益的细菌或真菌主要有酵母菌、益生芽孢菌、丁酸梭菌、乳杆菌、双歧杆菌、放线菌等 [2] 。
1.酵母菌：目前研究发现酵母菌具有调节肠道平衡、促进饲料转化以及提高机体功能等良好的益生特性，多作为饲料添加剂用于畜禽养殖。研究较多的酵母菌有酿酒酵母属、德尔布有孢圆酵母属、假丝酵母属、威克汉姆酵母属、毕赤酵母属、布拉氏酵母属、白球拟酵母属、薛瓦酵母属、深红酵母属、粟酒裂殖酵母属、鲍氏酵母属 [2] 。
2.益生芽孢杆菌：是一类对机体具有益生特性的、好氧或兼性厌氧、产芽孢的杆状细菌，为革兰氏染色阳性菌 [2] 。
3.丁酸梭菌：又名酪酸梭菌，是从健康人和动物肠道中分离出的一种厌氧的革兰氏阳性芽孢杆菌。目前研究发现丁酸梭菌具有维持肠道菌群平衡、增强机体功能、生成营养物质、防治肠炎等良好的益生特性 [2] 。
4.乳酸菌：乳酸菌指发酵糖类主要产物为乳酸的一类无芽孢、革兰氏染色阳性细菌的总称。乳酸菌是常见的益生菌，已经被广泛应用并认为对人和动物是安全的 [2] 。
5.双歧杆菌：其是人体内存在的一种生理性细菌，是人体有益菌中值得重视和研究的一种，它与人体的健康密不可分。

促进营养物质的消化吸收
益生菌可合成消化酶，它们与动物体合成的消化酶一起，参与肠道中营养物质的消化 [3] ，刺激动物体分泌消化酶，降低小肠隐窝深度，增加绒毛高度，增加小肠表面积，促进肠道营养物质的吸收 [4] 。
提高机体力
益生菌的自身结构如肽聚糖、脂磷壁酸等成分可作为抗原直接发挥激活作用，或者通过自分泌激活剂，刺激宿主系统，从而提高动物的力，增强机体固有细胞和自然杀伤细胞的活性，激活树突状细胞，刺激机体产生细胞因子，并刺激 B 细胞分泌抗体 [5] ，益生菌可刺激肠道产生分泌性球蛋白 A（SIgA），保护机体健康。
维持肠道菌群结构平衡
肠道不仅是机体正常的组成部分，参与机体重要的生理活动，同时，肠道中还存在复杂的肠道菌群，它们对宿主的生长、发育和健康等方面发挥着重要的功能 [6] 。
改善肉质
益生菌可通过抑制脂质过氧化，延缓高铁血红蛋白的形成，从而提高肌肉的亮度 [7] 。益生菌还可影响脂肪酸代谢，提高肌肉的嫩度。

提高机体抗氧化水平
机体中氧化物如氧自由基和羟基自由基等，含有未配对的电子，容易发生氧化还原反应，当机体中的氧化物过量时会导致机体产生氧化损伤。机体中存在着抗氧化系统，它们不断的清除机体合成的氧化物，维持着氧化物的动态平衡 [8] 。
抑制肠道炎症
益生菌可缓解机体的炎症反应 [9] 。
保护肠道粘膜屏障
益生菌可降低肠道粘膜渗透性，从而保护肠道粘膜屏障完整性 [8] 。
养殖水质调节
益生菌参与水体中的多种循环过程，通过自身的代谢，消耗水中的有机物质，减少水体中亚硝酸盐氮、氨氮的浓度，从而达到改善和维持良好水质的效果