目前不论哪种3D打印，基本都是用的STL格式的文件，STL文件说白了，就是用三角形表示实体的一种文件格式，这种格式是***开始发明3D打印的人定义的，现在已经成了图像处理领域的默认工业标准了。国外现在有一帮人在推一种叫AMF格式的3D打印文件，主要是增加了模型的材质、纹理、颜色等信息，可能以后技术进步，彩色打印成为主流，这种文件格式会逐步取代STL。但是，暂时应该STL格式的文件会是主流。
PS：还有obj格式，这种格式打印机基本都支持。不过比较少，STL是主流。
所以，题主问的问题，3D打印如何建模，我认为实质是问如何获得STL文件。这样，就有很多种方法了，看你是什么用途。我自己分类的主要有以下几种：
1、CAD设计（参数化建模）
2、CG建模
3、业余软件
4、人像DIY应用等
5、到模型下载网站下载别人设计好的模型