通常情况下，医院污水需要集中收集，经医院内部的医疗污水处理系统处理消毒后，流入城市污水管网，再经污水处理厂处理后可作为终水排放。其中，医疗污水处理的过程包括网格处理(剥离颗粒较大的杂物，如石块、塑料袋等。)、生化处理(好氧部分)和厌氧处理(厌氧部分，好氧和厌氧过程均可达到有效杀菌)，之后进行24小时沉淀处理，加药消毒(此阶段一般使用活性氧消毒粉)，从而监测COD、BOD等相关指标的达标情况。另外，在集中处理之前，医疗污水是通过的管道收集的，这个过程一般是封闭的。
调试步骤：
1、清水注满接触生化池。
2、启动风机，对池内污水进行曝气充氧。
3、重新进水，继续曝气。
4、如此反复运行，每天进水时间相对延长。
5、同时也可观察接触生物池内填料情况。
6、微生物的驯化需要较长时间，这样可加快生物膜的形成。
吸附法
用活性炭硅藻土矾土层片状织物聚丙烯聚酯片氨基甲酸乙酯泡沫塑料稻草屑及锯末之类能良好吸附溶剂的物质使其充分吸附后与吸附剂一起焚烧。