利用结构、设备管线BIM模型进行工程深化设计，是当前施工阶段BIM应用的重要体现。其应用方法有两种:①将所创建的模型，通过IFC或.rvt文件导入设计软件中进行深化设计，如利用Tekla进行钢结构及其复杂节点的深化设计，利用CATIA进行复杂异形结构、幕墙的深化设计等;②根据碰撞检测的分析结果，直接在BIM建模软件中对结构、水暖电管网及设备等设计进行调整、细化和完善。如利用Revit Architecture/Structure/MEP建模和深化设计，用Naviswork进行碰撞检测。
迄今为止，国内外软件厂商尚未推出商品化的BIM施工项目管理软件，而被业内认可并广为应用的是清华大学本课题组研发的基于BIM的4D施工管理的系列软件。该研究将BIM与4D技术结合起来，通过建立基于IFC的4D施工信息模型，将建筑物及其施工现场3D模型与施工进度链接，与施工资源、安全质量以及场地布置等信息集成一体。实现了基于BIM和网络的施工进度、人力、材料、设备、成本、安全、质量和场地布置的4D动态集成管理以及施工过程的4D可视化模拟。本系统己在国家体育场、青岛海湾大桥、广州西塔等大型工程项目中成功应用，曾获2009,2010年华夏建设科学技术一等奖。当前，通过进一步扩展信息模型、管理功能和应用范围，系统不仅用于建筑工程，而且己推广至桥梁、风电、地铁隧道、高速公路和设备安装等工程领域，正在上海国际金融中心、昆明新机场设备安装、邢汾高速公路等多个大型工程项目推广应用。
纵观当前工程施工中的BIM应用现状，清华大学研发的建筑施工BIM建模系统和基于BIM的4D管理系列软件不仅填补了当前国内BIM施工软件的空白，经过多个大型工程项目的实际应用，己经形成了包括BIM应用技术架构、系统流程和应对措施的整体实施方案。