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除了植物和动物的身体化石，古生物学家还研究动物的足迹和足迹化石，甚至动物粪便化石(称为粪化石)。这些化石很有启发性，因为它们揭示了史前动物是如何运动和吃什么。

虫管化石
又称“栖管化石”。指有些环节动物栖居的虫管保存而型成的化石。环节动物门、多毛纲中的有些类别分泌钙质虫管或分泌粘液，胶结砂粒、岩碎等而成虫管。虫体多无硬体，很难保存，仅有虫管常保存为化石。虫管为中空的管状体，直线形、U字形、旋卷或其他弯曲形状，断面圆形、椭圆形、三角形或多边形，表面可具有横脊或纵脊等。通常以管的一部分或全部附着他物上，单分散保存或密集成堆，甚至成礁状。

生物变成化石的更有趣和不寻常的一种方式就是在琥珀中保存。古代的昆虫可被某些针叶树分泌出的粘树胶所捕获。当松脂硬结后并进一步变成琥珀，昆虫便留在其中。有些昆虫和蜘蛛被保存得非常好，甚至能在显微镜下研究它的细毛和肌肉组织。