为提高冷却效果，整个冷冻集装箱的箱壁、箱顶和箱底内部，都铺有绝缘材料。冷冻集装箱工作的温度在－28℃＋26℃之间，根据货种的需要，可自动调节。保温集装箱主要用于装载水果、蔬菜等鲜货，一般是用干冰等冷却剂，防止箱内温度过度上升，通常的保温时间为72小时左右。
进行配载时，要达到如下要求： （1）船舶纵断面的强度和船舶的稳定性； （2）保持理想的吃水差，使其具有良好的操纵性和快速性； （3）合理地利用船舶的载重量和舱容； （4）集装箱在舱内完整无损； （5）要考虑便于装卸作业； （6）多港装卸时，对下面停靠港的装卸不要造成翻舱。
为运输需要保持一 定温度的冷藏或低温货物而设计的容器。它分为带冷冻机的内部机械制冷容器和不带冷冻机的外部机械制冷容器。适用于装载肉类、水果等货物。 冷藏集装箱的成本较高，运行成本较高，应注意冷藏设备的技术状况和集装箱内货物所需的温度。