袋进袋出过滤器的组成类似于组合式空调机组，是根据使用需要将不同的功能单元组合拼装于袋进/ 袋出箱体（BIBO Housing）内。常用的功能单元包括：预过滤器（Pre-filter）、粒子过滤器（ H E P A ）、气体吸附过滤器（HEGA）、精细扫描检测装置（Precision ScanTest Sections）等。
袋进袋出过滤器的过滤单元数量决定了其组合的方式，水平方向上排列过滤单元的个数称为W，高度方向上排列过滤单元的个数成为 H，如果某袋进袋出过滤器为2H2W型，则说明其水平及高度方向上各有 2 组过滤单元，箱体内共有 4组过滤单元。同时过滤单元的数量也决定该袋进袋出过滤器的风量,以经常使用的 24 英寸 ×24 英寸（610mm×610 mm）HEPA 为例,其在 250 Pa 阻力下过滤风量为 1700 m3/h，那么上述 2H2W 型过滤风量为6800 m3/h。在过滤单元组合时，水平方向上过滤单元的数量是有限制的，如 610 mm×610 mm 的过滤单元多只能排列三组（3W），这样才能在更换时操作人员能够顺利更换深一组过滤单元，而在高度方向上一般没有具体限制，可以根据现场实际情况确定。
特点
过滤单元更换
更换过滤单元时，工作人员打开检修门，将双手伸入PVC 袋上的手套里，松开过滤单元的锁定装置，将使用过的过滤单元滑入PVC 袋内，然后在中间扎紧袋子将包含过滤单元的部分剪下，这样废弃的过滤单元就通过PVC 袋子从箱体中移出。接着把新过滤单元装入新的 PVC袋子，再将新的 PVC袋子套在法兰口上扎紧，取下法兰上残余的袋口，放入新袋子的手套里，扎紧后将其剪下，再把新袋子卷好，关闭检修门并压紧，即完成了全部的更换过程。