吸粪车收集的粪便需要进行固液分离，所得液体进入城市污水处理厂进行处理。剩余的固体粪便残渣将被脱水，然后送往垃圾填埋场进行卫生填埋。填埋成本低，易于操作，但受填埋场的限制。
除了卫生填埋外，从化粪池中提取的粪便还可以在脱水后用于堆肥，类似于普通人用粪便制备农场粪便的方式。堆肥生产的有机肥料主要用于绿化或采矿等地区的土壤改良。
早在明清至民国时期，各大城市就有的粪便处理方法，这些方法被称为粪肥采集者，也被称为粪便收集者，负责整个城市的粪便收集和运输工作。
许多人可能会将其与城市环卫工人联系起来，但事实并非如此。当时，粪肥工人不必像现在这样为环卫工人买单。相反，粪肥工人自己支付这项工作的费用。此外，由于粪便在当时非常有价值，肥料工人职业的竞争非常激烈。一些粪肥工人甚至为了争夺一块土地而激烈斗争，甚至形成派系。粪便是当时农民好的肥料。城市居民有更好的土地吃，粪便的价值更高。为了明年获得丰收，他们将购买该市生产的粪便用于育肥。
技术加工
除了自然处理外，一些城市还使用技术处理方法来处理收集的粪便。常见方法包括：
1.生物发酵处理：粪便可以添加到酵母、霉菌等微生物中发酵，终将未消化的粪便转化为有机肥料。
2.厌氧处理：这种处理方法利用高科技设备通过厌氧菌的作用处理粪便，减少粪便造成的污染。例如，拉丁美洲国家的许多吸粪车都采用了这种处理方法。