有下列情形之一的，审批机关不予批准，并在作出不批准的决定时，书面告知申请人不批准的理由和依据：
（一）在地下水禁采区取用地下水的；
（二）在取水许可总量已经达到取水许可控制总量的地区增加取水量的；
（三）可能对水功能区水域使用功能造成重大损害的；
（四）取水、退水布局不合理的；
（五）城市公共供水管网能够满足用水需要时，建设项目自备取水设施取用地下水的；
（六）可能对第三者或者社会公共利益产生重大损害的；
（七）属于备案项目，未报送备案的；
（八）法律、行政法规规定的其他情形。
审批的取水量不得超过取水工程或者设施设计的取水量。
取水单位或者个人应当缴纳水资源费。
取水单位或者个人应当按照经批准的年度取水计划取水。超计划或者超定额取水的，对超计划或者超定额部分累进收取水资源费。
水资源费征收标准由省、自治区、直辖市人民价格主管部门会同同级财政部门、水行政主管部门制定，报本级人民批准，并报价格主管部门、财政部门和水行政主管部门备案。其中，由流域管理机构审批取水的中央直属和跨省、自治区、直辖市水利工程的水资源费征收标准，由价格主管部门会同财政部门、水行政主管部门制定。
制定水资源费征收标准，应当遵循下列原则：
（一）促进水资源的合理开发、利用、节约和保护；
（二）与当地水资源条件和经济社会发展水平相适应；
（三）统筹地表水和地下水的合理开发利用，防止地下水过量开采；
（四）充分考虑不同产业和行业的差别。
水资源费缴纳数额根据取水口所在地水资源费征收标准和实际取水量确定。
水力发电用水和火力发电贯流式冷却用水可以根据取水口所在地水资源费征收标准和实际发电量确定缴纳数额。
取水单位或者个人因特殊困难不能按期缴纳水资源费的，可以自收到水资源费缴纳通知单之日起7日内向发出缴纳通知单的水行政主管部门申请缓缴；发出缴纳通知单的水行政主管部门应当自收到缓缴申请之日起5个工作日内作出书面决定并通知申请人；期满未作决定的，视为同意。水资源费的缓缴期限长不得超过90日。
有下列情形之一的，审批机关可以对取水单位或者个人的年度取水量予以限制：
（一）因自然原因，水资源不能满足本地区正常供水的；
（二）取水、退水对水功能区水域使用功能、生态与环境造成严重影响的；
（三）地下水严重超采或者因地下水开采引起地面沉降等地质灾害的；
（四）出现需要限制取水量的其他特殊情况的。
发生重大旱情时，审批机关可以对取水单位或者个人的取水量予以紧急限制。