县级以上地方人民水行政主管部门或者流域管理机构，应当自收到取水申请之日起5个工作日内对申请材料进行审查，并根据下列不同情形分别作出处理：
（一）申请材料、符合法定形式、属于本机关受理范围的，予以受理；
（二）提交的材料不完备或者申请书内容填注不明的，通知申请人补正；
（三）不属于本机关受理范围的，告知申请人向有受理权限的机关提出申请。
取水许可实行分级审批。
下列取水由流域管理机构审批：
（一）长江、黄河、淮河、海河、滦河、珠江、松花江、辽河、金沙江、汉江的干流和太湖以及其他跨省、自治区、直辖市河流、湖泊的河段限额以上的取水；
（二）国际跨界河流的河段和国际边界河流限额以上的取水；
（三）省际边界河流、湖泊限额以上的取水；
（四）跨省、自治区、直辖市行政区域的取水；
（五）由或者投资主管部门审批、核准的大型建设项目的取水；
（六）流域管理机构直接管理的河道（河段）、湖泊内的取水。
前款所称的河段和限额以及流域管理机构直接管理的河道（河段）、湖泊，由水行政主管部门规定。
其他取水由县级以上地方人民水行政主管部门按照省、自治区、直辖市人民规定的审批权限审批。
批准的水量分配方案或者签订的协议是确定流域与行政区域取水许可总量控制的依据。
跨省、自治区、直辖市的江河、湖泊，尚未制定水量分配方案或者尚未签订协议的，有关省、自治区、直辖市的取水许可总量控制指标，由流域管理机构根据流域水资源条件，依据水资源综合规划、流域综合规划和水中长期供求规划，结合各省、自治区、直辖市取水现状及供需情况，商有关省、自治区、直辖市人民水行政主管部门提出，报水行政主管部门批准；设区的市、县（市）行政区域的取水许可总量控制指标，由省、自治区、直辖市人民水行政主管部门依据本省、自治区、直辖市取水许可总量控制指标，结合各地取水现状及供需情况制定，并报流域管理机构备案。
有下列情形之一的，审批机关不予批准，并在作出不批准的决定时，书面告知申请人不批准的理由和依据：
（一）在地下水禁采区取用地下水的；
（二）在取水许可总量已经达到取水许可控制总量的地区增加取水量的；
（三）可能对水功能区水域使用功能造成重大损害的；
（四）取水、退水布局不合理的；
（五）城市公共供水管网能够满足用水需要时，建设项目自备取水设施取用地下水的；
（六）可能对第三者或者社会公共利益产生重大损害的；
（七）属于备案项目，未报送备案的；
（八）法律、行政法规规定的其他情形。
审批的取水量不得超过取水工程或者设施设计的取水量。
取水申请批准后3年内，取水工程或者设施未开工建设，或者需由国家审批、核准的建设项目未取得国家审批、核准的，取水申请批准文件自行失效。
建设项目中取水事项有较大变更的，建设单位应当重新进行建设项目水资源论证，并重新申请取水。
依法获得取水权的单位或者个人，通过调整产品和产业结构、改革工艺、节水等措施节约水资源的，在取水许可的有效期和取水限额内，经原审批机关批准，可以依法有偿转让其节约的水资源，并到原审批机关办理取水权变更手续。具体办法由水行政主管部门制定。
取水单位或者个人应当缴纳水资源费。
取水单位或者个人应当按照经批准的年度取水计划取水。超计划或者超定额取水的，对超计划或者超定额部分累进收取水资源费。
水资源费征收标准由省、自治区、直辖市人民价格主管部门会同同级财政部门、水行政主管部门制定，报本级人民批准，并报价格主管部门、财政部门和水行政主管部门备案。其中，由流域管理机构审批取水的中央直属和跨省、自治区、直辖市水利工程的水资源费征收标准，由价格主管部门会同财政部门、水行政主管部门制定。
各级地方人民应当采取措施，提高农业用水效率，发展节水型农业。
农业生产取水的水资源费征收标准应当根据当地水资源条件、农村经济发展状况和促进农业节约用水需要制定。农业生产取水的水资源费征收标准应当低于其他用水的水资源费征收标准，粮食作物的水资源费征收标准应当低于经济作物的水资源费征收标准。农业生产取水的水资源费征收的步骤和范围由省、自治区、直辖市人民规定。
取水单位或者个人因特殊困难不能按期缴纳水资源费的，可以自收到水资源费缴纳通知单之日起7日内向发出缴纳通知单的水行政主管部门申请缓缴；发出缴纳通知单的水行政主管部门应当自收到缓缴申请之日起5个工作日内作出书面决定并通知申请人；期满未作决定的，视为同意。水资源费的缓缴期限长不得超过90日。