均质机结构分为平面型和W型两种，平阀可承受的压力，具有良好的耐磨损性，使用寿命长等优点。 W型阀是一种可在一组阀均质阀结构产生，大大提高了均一的效果。在同一时间，泵的阀“的结构指出球阀和光盘类型阀两种。传统均质器是蝶阀，易损耗，球具有耐高压，使用寿命长等优点，我们现在使用两种球阀和蝶阀，球阀是适合长时间使用高压的工作状态。
高压均质机是常用的设备，它由可产生高压的正向排代泵和排出阀组成，排出阀具有狭窄的小孔，其大小可以调节。细胞浆液通过止逆阀进入泵体内，在高压下迫使其在排出阀的小孔中高速冲出，并射向撞击环上，由于突然减压和高速冲击，使细胞受到高的液相剪切力而破碎。在操作方式上，可以采用单次通过匀浆器或多次循环通过等方式，也可连续操作。为了控制温度的升高，可在进口处用干冰调节温度，使出口温度调节在20℃左右。在工业规模的细胞破碎中，对于酵母等难破碎的及浓度高或处于生长静止期的细胞，常采用多次循环的操作方法。
均质机的分类及应用：每分钟的往复次数分为普通型均质机和低速型均质机。均质机曲轴的转速(即同比决定柱塞的往复频率)是决定整机性能的关键的因素之一。在材质、加工精度、结构等相同的情况下，在一定范围内转速越低，则各磨擦副(如轴与瓦、柱塞与密封等)在单位时间内的磨损度、泵体内各受力零件(如阀芯、阀座等)在同等时间内的损坏程度均大幅度降低，且设备运转的稳定性也大大提高。所以该系列特别适合于长时间使用的场合。