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有害生物防制员要知道控制的有害生物属于哪一类，主要识别的依据是什么。要准确鉴定物种有很好的生物分类学的基础知识，特别是昆虫分类学的基础。对于有害生物防制员来讲，不要求系统地掌握生物分类学的基础理论，主要是根据一些外部形态特征、发生的环境等来判别是属于哪一类有害生物或是哪一种有害生物即可。
一般生物的分类，别叫做“界”，例如动物界。界下边是“门”，再下依次为“纲”“目”“科”“属”和“种”。例如，昆虫属于：动物界，节肢动物门，昆虫纲。昆虫纲的生物主要特征为：身体分为头、胸、腹3段，在胸上有3对足，一般具有2对翅(有些从表面上看退化为1对翅)和1对触角。蜱螨类具有4对足，身体一般分为2节，很容易与昆虫区分开来。鼠类有2对足，不是节肢动物，和昆虫、蜱螨类是完全不同的。

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除鼠类外，常见的有害生物多数属于昆虫纲和蛛形纲。昆虫纲可以分为33个目(不同的分类系统总的目数会有些差异)，其中与有害生物防制员这个行业相关密切的有双翅目(如家)、蜚蠊目(如德国小蠊)、蚤目(如跳蚤)、虱目(如体虱)、半翅目(如臭虫)、膜翅目(如蚂蚁)等。如图22所示为常见的有害生物。对于有害生物的识别，多数是利用体表的形态结构特征，有时利用内外生殖器的特征。一般分目主要是利用翅、足、口器(就是害虫的口)、体节、触角等的形态特征，些重要的昆虫生态学特征参见表22。

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中国鼠类近200种，大小不一，外形各异，但全身均可分为头、胸、腰、尾5个部位。
鼠类头部多狭长，吻端尖出或钝圆，嘴旁有须。耳和眼的发达程度差别较大。颈部的分化在多数鼠种中显著。鼠类前、后肢各1对，随生态习性的不同，有的前肢发达，有的后肢有力。指、爪形状和数目因种而异，多为带爪的五指形，但变化较多，有的指下有肉垫或长毛。爪色有黑、黄、白。雌鼠有乳头3~6对，鼠蹊部有尿道、阴道和肛门开口。雄鼠只有尿道口和肛门两个小孔，且相距较雌远。多数啮齿动物有尾，尾的长短、形状、毛量和毛长各种不同。少数尾短甚至没有。