为了避免冷藏集装箱内壁面产生凝结水，可采取如下措施：
1． 如果箱内湿度正常，则应设法提高隔热壁的内部热阻（减小K值），或设法减小内表面的对流热阻，以提高内壁面的温度t2，例如增加箱内空气流速。
2． 如果箱内空气湿度很大时，采用上述方法是无效的。这时，应该在内壁面增加防水层，以免水分渗入隔热壁内部。
至于隔热壁内部结露，主要是由于箱内外水蒸气的压力差和隔热壁的渗透性造成的。由于隔热壁两侧空气温度的不同，即使两侧空气的湿度相等，温度高的一侧空气的水蒸气分压力也比温度低的一侧大。这样会产生水蒸气分压力差，此时水蒸气将从水蒸气分压力高的一侧通过隔热壁向分压力较低的一侧渗透。
冷藏集装箱除了货物的设定值和送风、回风温度外，温度控制系统还会以错误代码的形式提供有关系统问题的详细信息。货物温度可通过美国农业部（USDA）探测仪记录，安装该探测仪是为了符合美国农业部针对水果的运输的冷藏处理程序。托运人放置于所载货物中的数据记录仪也会记录大体温度。当冷藏装置失灵时，温度显示和数据记录将会展示一个逐渐稳定的温度上升直至终达到周围环境温度值过程。再次强调，感应器只会记录空气温度，而非货物温度。货物将会受到周围绝热材料一定的保护，防止受到外部空气温度的影响。
二手冷藏集装箱的冷藏制冷能力有限，主要用于保持货物温度。也是说，人们把-20℃的货物装进去，它能保持货物在-20℃，地运送到目的地；人们把5℃的货物装进去，它能保持货物在5℃下地运送到目的地。如果把常温下（20℃）的货物，直接装箱并要求它冷冻到-20℃，将无法实现。因此，货物在装入二手冷藏集装箱之前需先降温到温度。