高新技术企业认定部门一般是科技部、财政部、税务总局负责全国高新技术企业认定工作的指导、管理和监督。各省、自治区、直辖市、计划单列市科技行政管理部门同本级财政、税务部门组成本地区高新技术企业认定管理机构。认定机构下设办公室，由省级、计划单列市科技、财政、税务部门相关人员组成，办公室设在省级、计划单列市科技行政主管部门。
高企认证企业的知识产权通过自主研发、受让、受赠、并购等方式，获得对其主要产品（服务）在技术上发挥核心支持作用的知识产权的所有权；专利有效；知识产权权属人为申请企业；多个权属人的申请高新技术企业及高新技术企业资格存续期内，只能由一个权属人在申请时使用；Ⅱ类专利只能使用一次。
高企认定费用：
1、管理费是高企代理机构的明确的收费项目。该项目没有市场定价。据企业实际状况而定。一些公司的材料比较，公司管理也比较规范，规模也不大，操作企业比较简单，费相对比较便宜，而有些公司的状况比较混乱，管理不到位，或者有些大型企业，营业额大几亿亿，甚至几十亿亿上百亿的。那工作内容增加很多价格自然不一样。
2，专利费
根据专利申报数量和企业技术交底的状况，价格会出现上下波动。（详情可咨询中睿兴旗下苏州思睿晶华知识产权事务所）
3，审计费
审计费用具有高企审计的会计事务所，价格根据地区和公司状况而定。（中睿兴信息可以有限公司合作的审计机构都是有资历的长期合作的审计机构。）
4，查新费
查新报告有具备的的第三个方查新企业出具。具体价格视域和企业状况而定一般一件700元上下
5，产学研
大部分企业没有产学研合作协议，目前高企代办中介机构会提供相关服务。收费没有统一标准，根据合作的大学院校而定。
目前来看，高新技术服务费有两种主要模式
一、固定金额
即：双方就认定代办一事谈定一个固定的价格和确切的支付条件以及支付时间。使用这种支付方式的一般为老牌的正规机构。
二、比例提佣
即：企业通过认定，拿到相关补贴后。机构按照比例抽取一定的。至于比例，由双方商定。实用此类支付方式的，一般为近几年新成立的机构。因近年高企补贴大幅度提升。催生的新的机构和新的收费模式。
对于校企合作这块费用，很多企业很迷惑。不知道企作用与价值更不明确其市场价格。思睿晶分一下几点为您讲说
一、产学研协议在高企审核中隶属于企业研发管理水平。这一项共计20分。而校企合作协议在其中占4分。
二、当前高企审核日趋严格的形势下。框架性质的校企合作协议，不太会被认可。只有能够提供相关的真实校企合作才被认可。
三、有支撑的校企合作协议，其成本不低于5万元。千万不要相信一些不良机构所说的，钱从学校账户走一下就出来的鬼话。学校的钱，哪有那么容易出来的？
四，对于 高企而言，总分100份，71分算通过。足有29分可口。左右分值只有4分的校企合作协议，所占分量并不高。
作为高企认定行业的老法师，思睿晶为您解读
一、高企审计报告金额有据可依
高企审计报告的金额，一般由企业的营业额和资产总额决定。数额越大的，价格越高。另外，高企的审计报告有三年年度审计报告、高新技术产品销售收入专项报告、近三年研发费用专项报告组成。审计机构也会按照出具的份数收费。例如：三年年度研发费用专项审计报告可以合并在一个报告里出具。也可拆分为三份报告。如果拆成三份出具，价格自然比一份的高。
二、跟事务所规模有关
一般来说，大所收费高，小所收费低。目前来看，在一个城市内，大所的收费是小所的三到五倍 乃至十倍。
三、事务所选择
思睿晶建议您既不要选择贵的，也不要选择的。而应该选择沟通的。在高企审计中，对于高新技术产品和研发费用方面，虽有规定，但很多具体费用并没有严格的界定，因此，事务所能否认可材料，能否听取企业的解释显得尤为重要。因此，好沟通是事务所选择的要素。