洁净车间作为一个“受控环境”，具有不同于其他建筑工程的特点，尽管任何建筑工程都包括设计、竣工验收、日常维护等环节，但是洁净车间还需要通过调试、检测和综合评价予以确认，绝不可草率行事，匆匆投入运营。
洁净车间设计内容有：
1.合理布置工艺流程和建筑平面;
2.选择满足洁净车间特点的建筑构造和材料;
3.洁净车间设计应依据当时当地的能源供应背景，选定可靠和经济的冷、热源;
4.划分和布置空调净化和排风系统;
5.选择合理的空气净化通风设备;
无论是新建还是重新改造的洁净车间，都一定依照国家相关标准、规范进行。