猪粪质地较细，含有较多的有机质和氮磷钾养分，猪粪分解较慢，适宜做基肥，但人们通常认为猪是很脏的动物，其实猪是很爱干净的，在猪圈中，猪的吃喝拉撒睡都有固定的位置，在现代化养猪条件下，猪粪处理是一项关键的环保技术，否则会引起环境污染，经过滚筒反应器好氧发酵处理，可以猪粪便加成有机肥，达到、无排放、无臭味，使粪土变成黄金。现有的猪粪发酵时，只是对其进行简单的处理，现有的猪粪发酵装置在使用时，效果不好，降低了发酵效率，同时会产生硫化氢，影响环境和人身体健康，不方便使用者的使用，降低了猪粪发酵装置的实用性。
有机废弃物，包含人畜粪便、餐余垃圾、污水处理厂的副产品污泥、瓜果蔬菜市场废弃的烂瓜果烂菜叶等等，其年产量是同期工业固体废弃物产量的10倍，量大且集中，如不及时处理将带来严重的环境污染。对有机废弃物进行堆肥化处理(好氧发酵)可以实现废物的资源化利用，因此获得了广泛的应用，人们尝试着开发了众多的好氧发酵反应器，试图提高好氧发酵的效率，降低发酵设备的制造成本和运行成本。
目前，化肥被大量施用以保持农林业高产。但是，随着化肥用量不断增加，土壤开始板结，化肥淋入地下水也将造成水污染。近年来，我国提倡有机农业，大量应用有机肥，达到保持作物产量的同时，保护土地和环境。畜禽粪便是有机肥重要来源，2016年我国仅养殖肉牛产生的牛粪就达到15万吨以上，为我国有机肥生产提供了充足的原料。另外，我国小麦历年种植面积为我耕种地总面积的22％～30％，产生大量小麦秸秆，秸秆为养殖业提供饲料，也为有机肥生产提供了丰富原料。但是，丰富的原料只是生产的基础，重要的是对这些原料的加工利用。其中关键的是有机肥原料的发酵腐熟技术不断发展与创新。
菌肥的使用方法：
1. 施用量：一般情况下，每亩土地使用菌肥的量为10-15公斤。
2. 施用时间：菌肥可与基肥一同施用，也可作为追肥使用。一般在种植前2-3周施用，或者在植物生长期间按需追肥。
3. 施用方式：菌肥可直接撒在土壤表面，然后轻轻耕入土中，也可与底肥或追肥混合使用。 需要注意的是，菌肥的保存要避免阳光直射和高温环境，尽量保存在阴凉干燥处。
此外，在施用菌肥时，应避免与农药等化学物质混用，以免发生不良反应。
有益微生物进入土壤会在根系周围产生大量粘多糖与植物分泌的粘液及矿物胶体、有机交替相结合，形成土壤团粒结构，提高土壤蓄肥、保水能力，促进根系生长，使作物生长健壮。另外所含的固氮菌、固碳菌具有从空气中固氮、固碳的能力，可以为作物补充氮源、碳源；第二，奥农乐中所含的20味中草药及海藻经微生物发酵后，转变为多糖类、生物碱类、类、腐殖酸类、海藻素等高能量物质及功能性物质，可以通过提高作物叶片中叶绿素的含量达到营养复壮、提质增产的效果，可提高作物体内的酶活性，提高作物力、抗逆性；第三，奥农乐中含有的钾、钙、镁、磷、硫、铁、锌、硼、硒、硅、锰、钼等矿物元素都是作物正常生长所的，这对于平衡作物营养、增强抗逆性具有重要作用。
微生物菌肥集生物菌、中草药、矿物质三效合一，从二十余味中草药及海藻中发酵出的多糖类、生物碱类、类、腐殖酸类、海藻素等生物活性成分，为作物补充高能量物质及功能性物质，能够开启并促进植物次生代谢。