冷藏集装箱应注意温度读数的增加不会立即对货物的实际温度产生影响，也并不意味着制冷装置处于不稳定状态。电子数据记录除了温度以外，通常还会显示除霜间隔和持续时间。如果装货温度超过了设定温度，冷藏装置将会开始自动的将货物温度降至符合要求的温度水平。如果货物已经解冻，冷藏装置将会尝试降低货物温度但会持续频繁进行除霜。
用冷冻集装箱运输冷冻货物时，温度不得-18℃。一般来说，英尺冷藏集装箱的平均冷却速度为31.3℃/h（空集装箱）；然而，装载后，由于货物的热容量较大，冷却速度将大大降低。有时需要15-16h才能达到设定的温度要求。如果输入温度高，需要2-3D才能达到设定温度。
冷藏集装箱促进食品冷链发展
冷藏集装箱可通过各种运输方式用于多式联运。他们可以实现从原产地到销售点的“国与国”直接运输。在某些条件下，它们可以用作移动式冷库。使用时可整体吊装，装卸，运输成本相对较低。冷藏集装箱的应用在一定程度上可以促进食品冷链的发展。