冷藏集装箱运送冻结货时通常使用温度应不-18℃。通常英尺冷冻集装箱，平均降温速度为31.3℃ /h（空箱）；但装货后，由于货物热容量较大，降温速度会大大减慢，有时达到设定温度要求需要15-16h。若进货温度较高，则达到设定温度需要2-3d。
根据冷藏集装箱材质，冷藏集装箱可以分为铝质冷藏集装箱和钢质冷藏集装箱。由于铝质冷藏集装箱的成本比较高，且容易损坏，维修费用高，所以在2000年后逐渐被淘汰，主要生产钢质冷藏集装箱，在SHSCRC（COM）可以看到相关图片。
冷冻集装箱保鲜货物因有呼吸作用而产生二氧化碳、水汽、少量乙烯及其他微量气体和热量。堆装方式应当使冷空气能在包装材料和整个货物之间循环流动，带走因呼吸产生的气体和热量，补充新鲜空气。有以下两种标准装箱方式。