USDA颁布了降低木质包装传入有害生物风险的准则。由于 木质包装经常重复利用，真实来源很难确定，因此其处理状况很难确定。
对于熏蒸，木质包装在密闭地方，于规定的溴甲烷剂量下熏蒸至少16小时，然后置于通风处，使其熏蒸剂的浓度降到安全浓度以下。
消毒方式
有使用药物和热处理两种方式，使用药物为：溴甲烷、环氧乙烷
1、把要熏蒸木箱的货物堆码整齐，用苫布盖好，四边压实，使之密封，但要留出一角做投药口。
2、在苫布下、货物旁放一盆清水，把药投入水中
3、把预留的投药口压实，使需要熏蒸木箱的货物处于完全密封状态下保持24小时
4、打开苫布通风，待毒气散尽即可移动货物，大概18－24小时
5. 开出免熏蒸木箱（消毒）证书。