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实验室超纯水机按原水种类来分有两种：以自来水为水源的实验室超纯水机、以蒸馏水（或去离子水、反渗透纯水）为水源的实验室超纯水机。就目前国内实验室超纯水机使用的情况来看，以自来水为水源的实验室超纯水机占主流，这与当前国内大多数实验室没有配置纯水系统，纯水水源取用不便有关。以自来水为水源的实验室超纯水机，大都以反渗透作为脱盐制取纯水的主要工艺，并与离子交换工艺结合，可将自来水（含盐量通常在1~4ppm之间。