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荔枝根系因苗木繁殖方法不同而异。实生树及嫁接树有发达的主根；高压（圈枝）繁殖的荔枝侧根须根发达，没有主根。荔枝的根系由很多粗壮发达的侧根和纤细茂密的细根所组成，初生的幼根白色，肉质，质脆易断，俗称“豆芽根”。

荔枝为聚伞花序，圆锥状排列。花穗由主穗、侧穗、支穗及花组构成。主穗基部（龙头桠）及叶腋处还抽生若干腋侧穗。

3～10个支穗组成一个侧穗。6～20个侧穗和若干腋侧穗组成一个聚伞圆锥花序。荔枝花序上小花着生的疏密因品种而异。