通常情况下，医院污水需要集中收集，经医院内部的医疗污水处理系统处理消毒后，流入城市污水管网，再经污水处理厂处理后可作为终水排放。其中，医疗污水处理的过程包括网格处理(剥离颗粒较大的杂物，如石块、塑料袋等。)、生化处理(好氧部分)和厌氧处理(厌氧部分，好氧和厌氧过程均可达到有效杀菌)，之后进行24小时沉淀处理，加药消毒(此阶段一般使用活性氧消毒粉)，从而监测COD、BOD等相关指标的达标情况。另外，在集中处理之前，医疗污水是通过的管道收集的，这个过程一般是封闭的。
实验室污水处理是一个非常重要的议题。实验室污水中含有大量的有机物和无机盐等化学物质，如果不经过处理直接排放到环境中，将对环境造成严重的污染。
实验室是各种科学研究和生产活动的场所，其中高频率的实验和研究活动会产生大量的有机物和无机盐等污染物质，这些污染物质会危害到人类的健康和环境的稳定性。实验室污水处理可以把这些污染物质从污水中到去掉，使其能够安全排放到周围环境中。
生物化学处理法
用活性污泥之类东西并吹入空气进行处理。例如，对含有乙醇、乙酸、动植物性油脂、蛋白质及淀粉等的稀溶液，可用此法进行处理。