在传统的办公管理中，每一份文件都要进行严密的分析、解读，以纸质的形式不断的进行着修改，这样不仅降低了工作效率，也使员工的工作量增多，同时也很容易出现修改失误或文件信息丢失的问题，致使文件中的信息存在漏洞。而办公自动化系统，能够实现自动化的管理各类文件。利用计算机网络技术对文件进行分类和统一的传输，在保留好原文件的前提下，提出一些可行性的建议。同时企业要对办公自动化系统进行严格的管理，并要求工作者通过身份验证才能够登录系统，并查看所需要的文件资料，有效的了企业内部文件的严密性。
在企业管理中，是否正确的决策是确保办公管理的基础，使用办公自动化系统能够自动对文件进行核对，如人事关系、财务账目等。而办公自动化可以对涉及到决策的相关资料进行科学的分析，这样能够有效的提高决策的科学性与数据的度。
在办公自动化系统中，工作流技术的实施主要是通过工作流管理系统来实现的。工作流管理系统是一个软件系统，它通过计算机技术的支持完成工作流的定义和管理，并按照在计算机中预先定义好的工作流逻辑推进工作流实例的执行，工作流管理系统将现实世界中的业务过程转化成某种计算机化的形式表示，并在此形式表示的驱动下完成工作流的执行和管理。
与过去对纸质文件的审阅方式相比，通过OA系统处理收发文件及共享信息资源可以节省大量纸张，降低办公成本。领导可直接在OA系统上阅读、审批和修订电子文件，并保留阅读和修改的痕迹，解决了过去因反复修改文件草稿而浪费大量纸张的问题，而且，电子文件在OA系统上可同时向多人传阅，缩短了文件传阅的周期，杜绝了纸质文件丢失的可能性。
在企业的行政管理中，应用办公自动化系统，可以将行政审批与文件的流转相集成，利用办公自动化系统来实现财务、会议、后勤、人事等一系列的行政管理工作，如在日常行政工作中的用车派车、员工考勤等，只要登录自动化办公系统就可以方便快速的处理，不仅提高了行政部门的工作效率和管理水平、也使财政部门的工作变得更加方便快捷。
在如今的网络时代，OA作为具有企业级的跨部门的运作特点的基础性信息系统，有效将企业各岗位上的工作人员进行联系，并将企业信息系统和各类信息资源进行有效的结合。如今，许多企业都成功将自己的办公系统建立起来，并使用了各种财务管理软件，被引入的各种系统中如ERP系统、SCM系统、HR系统、CRM系统等等。这些系统会形成各种一的风格，无法让企业更加。由此可见各类系统的整合及各系统是否能够地协同工作是非常重要的，在以后的发展方面，OA需要将企业中已存在的MIS系统、ERP系统、财务系统等存储的企业经营管理业务的数据，系统界面和账户的统一，紧密顺畅的业务流程，与公文的流转、发布信息、核查审批进行整合，使之实现无缝集成协同的办公平台。