空气污染研究：SEM+EDS可以用于分析空气中的颗粒物、污染物等物质的微观结构和化学成分，研究其来源、扩散和沉降等过程。例如，对于大气颗粒物，可以通过SEM观察其形貌和粒径分布，通过EDS分析其元素组成，探究其对人体健康和环境的影响。
SEM可以观察土壤中重金属、有机污染物的形貌和分布情况，而EDS可以分析这些物质的元素组成。这有助于了解土壤中污染物的赋存状态、形态和浓度，进而评估不同土壤修复技术的可行性和效果。
SEM可以用于观察土壤、水体等环境中的微生物形态和结构，如细菌、真菌、病毒等。EDS可以用于分析微生物的元素组成，有助于了解微生物的生态学特性和环境适应性。