在传统的办公管理中，每一份文件都要进行严密的分析、解读，以纸质的形式不断的进行着修改，这样不仅降低了工作效率，也使员工的工作量增多，同时也很容易出现修改失误或文件信息丢失的问题，致使文件中的信息存在漏洞。而办公自动化系统，能够实现自动化的管理各类文件。利用计算机网络技术对文件进行分类和统一的传输，在保留好原文件的前提下，提出一些可行性的建议。同时企业要对办公自动化系统进行严格的管理，并要求工作者通过身份验证才能够登录系统，并查看所需要的文件资料，有效的了企业内部文件的严密性。
在企业管理中，是否正确的决策是确保办公管理的基础，使用办公自动化系统能够自动对文件进行核对，如人事关系、财务账目等。而办公自动化可以对涉及到决策的相关资料进行科学的分析，这样能够有效的提高决策的科学性与数据的度。
在企业的行政管理中，应用办公自动化系统，可以将行政审批与文件的流转相集成，利用办公自动化系统来实现财务、会议、后勤、人事等一系列的行政管理工作，如在日常行政工作中的用车派车、员工考勤等，只要登录自动化办公系统就可以方便快速的处理，不仅提高了行政部门的工作效率和管理水平、也使财政部门的工作变得更加方便快捷。