冷藏集装箱具有良好的隔热性，可以保持一定的供温要求，适合于运输和存情各种易腐食品。一种设计用于运输需要一定温度的冷冻或低温货物的容器。冷藏集装箱分为带冷冻器的内置机械冷藏容器和不芾冷冻器的外部机械冷藏容器。
冷藏集装箱租赁的灵便租用方式在花费上类似长期性租用，在应用上与短期内租用类似，可灵便应用。这类租用方法租赁期一般为一年。在海运集装箱运输量大，运营航道较多且来往返运输量不平衡的状况下，选用这类租用方法能较为非常容易融入转变，是一种很有价值的租用方法。
利用冷藏集装箱运输水果时，应考虑水果的呼吸作用和乙烯的催化作用，控制冷藏集装箱内的温度。气体法是一种比较普遍的方法，它意味着用气密材料包裹果蔬，使果蔬不能与同一种气体交流，果蔬根据自身的呼吸作用，使贮藏环境的气体含量达到适当的标准。可以适当地跳入机身，保持各种机身的平衡。其次是连接基调法。该方法是指通过检测设备检测并调整冰箱内部的气体含量，以使设定的基准与冷藏集装箱内部的各种气体的成分一致。