钻孔取芯机钻孔时，应手感阻力不大，切削平稳，钻时进给速度为4-5m/min左右当钻孔接近完毕时。钻机行走到需要工作的位置后，将行走轮向后摆动180度，并操纵手柄使行走轮与方向轮离开地面，调整四只调节螺栓，使底座稳妥地置于工作位置上，此时底座平面离地。
如在钻进过程中，出现钻头不能钻进，钻头表面金刚石部分没有全部露出，需用强磨耗材料（如耐火砖，砂轮 等）开刃，时钻头表面曾金刚石完全露出，此时用手模 表面层，由毛糙感，方可进钻。停钻时先关机器后关水，若是深孔时，还不能立即提钻和停水，而要用水冲孔一段时间，目的在于将孔内的岩粉冲洗干净，以防岩粉沉淀导?致埋钻，造成取芯困难。
使用钻孔取芯机前应仔细阅读机器的操作手册，不要进行无水作业。取芯完成后，要把适当部位擦净、晾干、涂油。待钻孔取芯机切削完毕，可保持旋转，提升钻头，距试件表面约有5mm时，可关闭电源，钻头离开试件表面，关闭水源，卸去固定螺栓，拖离取芯机，用夹钳取出试样。
设备取芯慢可能是钻头过钝，皮带老化、皮带松等问题。需要更换新钻头。如果转速慢就要更换新标准角带，调整紧带螺栓。取芯所需时间很小，非常稳定，有效地延长钻头寿命，快速取芯的汽油机动力系统。使用时，应防止钻头撞击坚硬物体，以免损伤钻头。
钻孔取芯机安装上合适直径的空心钻头，将钻孔移至所需工作处，用膨胀螺丝将钻孔固定，调整地脚螺丝，使钻机稳定。如果机器在工作时汽油机冒烟，可能是机油过多，1需要抽出部分机油，机油进入燃烧室、卸下火花塞，然后拉动起动手柄，把机油完全排出。大钻孔取芯直径可以达到200毫米，大钻孔取芯深度700毫米。
钻孔取芯机长时间使用或使用多次后，应检查一遍各部位螺栓，是否有松动现象，以防影响和耽误正常使用。不能用铁锤敲击钻头或岩芯，不能用铁棍从钻头后部插入敲击岩芯，以免损坏薄壁钻头。钻孔取芯机的汽油标号不够，汽油机没劲需要换上标号汽油，阻风门关闭，调速器往回转动，把开阻风门。