SEM+EDS可以用于研究环境污染物质对生物体（如鱼类、昆虫等）的毒害作用及其机制。通过观察生物体在不同污染环境下的形貌变化和元素分布情况，可以深入探究环境污染物质对生物体的毒害作用及其与环境因素的相互作用。
失效分析：在航空航天领域，失效分析是非常重要的工作。SEM+EDS可以用于失效模式的识别和分析。例如，对于飞机涂层的剥落和掉漆问题，SEM可以观察到涂层表面的形貌和结构，而EDS可以分析涂层中的元素组成。这有助于确定涂层失效的原因和解决方案。
SEM可以用于观察化石和古生物标本的表面形貌和内部结构，如恐龙、猛犸象等。EDS可以用于分析古生物标本中的元素组成，有助于了解古生物的食性、生活环境和演化历程。