由于果壳活性炭对水中的预处理要求高，而且活性炭价格较昂贵，因此在废水处理中，果壳活性炭主要用来去除废水中的微量污染物，以达到深度净化的目的。
可以处理水质中的可溶性杂质
虽然一些不溶性有机物分子的危害较大，但一些可溶性物质同样让人，如农药等物质，溶解在水中，排放起来对环境构成威胁，处理起来有相当困难，果壳活性炭依靠强大的吸附能力，不但对于有机物吸附效果到，对于可溶性农药等物质吸附效果也是。
可以净化水质的异味
污水不但含有大量杂质，且十分难闻，在要求果壳活性炭吸附效果的同时，还能够改善水质的异味，果壳活性炭利用自身强大的吸附能力，对于水质中的异味、臭味、性气体有很强的去除效果。