保育舍管理成功的关键是完善的卫生程序。为断奶仔猪提供干净而无菌的环境，有助于减少保育舍猪只被致病微生物侵染。假如断奶仔猪断奶时面临的是上批猪所遗留下的致病菌，那么要达到理想的生产性能是非常困难的。
当猪圈和猪舍腾空后，应进行的浸泡、冲洗和消毒等程序，包括天花板、风扇、通道的出入口和常用的圈舍设施设备。
应仔细清洗料槽和饮水器，由于断奶仔猪适应新的饮水方式，因此断奶后水质是极其重要的。在空栏后应对整个供水系统按产房所推荐的方法进行清洁消毒。
清洗和消毒以后，保育舍应在进猪前干燥和空栏。
断奶前，保育舍的温度应尽可能达到理想的设置，进猪后房间温度应快速维持稳定。