微生物菌体的蛋白质含量很高，按其干重计算，细菌一般为40%～80%，酵母菌为40%～60%，霉菌为15%～50%，藻类为60%～70%。微生物蛋白所含人体8种必需氨基酸量略大豆蛋白质，另外，含有维生素以及胡萝卜素、麦角固醇等，因此是一种理想的蛋白质资源。
微生物发酵饲料中营养成分高，提高了养分利用率，适口性好。含有多种有益微生物，如霉菌、酵母菌及细菌的一些类群，可补充有益菌，调节动物的微生态平衡，增强了猪只的力，使猪只健康程度提高，减少了用药成本，消除排泄物臭味等方面。解决抗生素残留和环境污染等问题，还能调整农业产业结构，实现能源综合利用，促进农业的可持续发展。
玉米蛋白粉含有丰富的叶黄素，其含量高达90-180mg/kg，是黄玉米的5倍以上，能有效地被鸡群吸收，使鸡群皮肤呈黄色，蛋黄颜色加深，可相应减少饲料中外源色素的添加量。但是玉米蛋白粉中的色素成分容易氧化而消失，其影响因素主要包括温度、季节、储存条件和时间、生产方式及玉米原料等，因此使用时应注意缩短贮藏期和控制贮藏中色素含量的变化。