鸽子粪有一很高的药用价值，将晒干鸽子粪用纱布包起来，放入盘中加入开水，先利用水蒸气对的部位进行熏蒸，等水温凉下来的时候再用水洗，每天洗上两三次，对特别有效。
在养殖鸽子的过程中，很多人都会觉得鸽子粪便不知道如何处理，有时也就只能随便堆放在一起，或者是放在田间，用作农家肥使用。其实鸽子的粪便是含有一定的蛋白质、氨基酸、维生素和微量元素，可除了作化肥还能用作饲料。
鸽子粪是农家肥，鸽子粪经过发酵后，是养花种菜的好肥料。特别是在农村用鸽子粪种植的西瓜，瓜大皮薄，又沙又甜！用鸽子粪养花种草，可以减少污染，废物利用，美化环境，修身养性，老有所乐，有益身心健康。
虽然鸽子粪对于人来说是一个大麻烦，但是在16-18世纪的欧洲却被当作无价之宝，当时鸽子粪被认为是比农家肥要有效的肥料。以至于会有武装警卫守护在鸽子窝的周围，防止小偷偷走鸽子粪。 不但如此在16世纪的英国，鸽子粪还是已知的硝石来源，而硝石是制作黑色火药的重要成分。在伊朗，食用鸽子肉是被禁止的，鸽子窝就是为了收集鸽子粪当作肥料种植瓜果，而在法国和意大利则用来培养葡萄和麻类作物。
，准备足够的鸽子粪、玉米粉15%、麦麸5%、金宝贝饲料发酵剂1‰左右，再加水搅拌，充分的与鸽子粪混匀，使总物料的含水量控制在60~65%左右。后在上层覆盖保温草帘，发酵过程中要注意避雨，当发酵料的内部温度达到50-60°C以上时翻倒1次即可。当鸽子粪呈黄绿色无臭味而略带酒香味时，表明发酵基本完成，即可饲喂。
一般情况下，鸽子粪需要经过发酵后再使用，不能晒千后直接使用，因为鸽子粪在土壤中发酵会产生大量的热量，导致植物烧根。如果想要直接使用，应当和作物的根系保持一定的距离。对蔬菜施肥，先挖一个深坑，然后用三明治法覆盖土壤。对果树施肥，先在果树周围挖环状浅沟，深0.1m，再将鸽子粪施入沟中，覆土。