微波烘干设备的杀菌原理是微波电场的热效应与生物效应双重作用的结果，有效杀灭麸皮附带的细菌、霉菌、大肠杆菌等，提升产品品质，延长产品的保质期。物料在75-85℃的微波场中2-3分钟即可完成杀菌的过程，无需二次杀菌，无需杀菌药物投放，没有化学药物残留，无需高温杀菌，杀菌时间短，提升产品品质，节省费用。
目前，我国已在皮革、化工、彩色印刷、食品、农产品、纸张、化工、陶瓷、药业、建材、乳胶枕等行业逐渐采用微波技术，并取得了良好的经济效益。微波能技术作为一种新的加工手段，对各行业的技术改造和设备更新已形成地冲击。特别是现阶段，摆在各经营者面前的是解决产品结构与社会需求的问题，适应社会发展对产品品质、品种要求的提高。其焦点之一就是技术创新不足、品质升级滞后。微波技术的出现为提高产品档次、跟上技术进步、创高附加值产品提供了良好条件。