生物箱的生物除臭工艺的原理是利用微生物的生物降解作用对臭气物质进行吸收和降解从而达到除臭的目的。臭气通过湿润、多孔和充满活性微生物的滤层，利用微生物对恶臭物质的吸附、吸收和降解功能，微生物的个体小、表面积大、吸附性强、代谢类型多样的特点，将恶臭物质吸附后分解成CO2、H2O、H2SO4、HNO3等简单无机物。生物滤池法除臭，适合大气量低浓度的废气处理。
恶臭气体不仅对生态环境造成严重影响，而且对人体健康具有的危害，会使产生障碍、病变，引起慢、急。杂环香料的阈值低、气味强度大且不愉快，在生产和包装过程中极易有大量的气味逸出，对公司内部和周边人群易造成身心不愉快。
生物除臭技术目前我国使用较为广泛而且行之有效的除臭处理工艺。
随着污水处理厂数量和规模的不断扩大，生物除臭技术暗藏的一些问题也逐渐显现。其中，集气系统由于密封复杂和密封不严问题，导致恶臭气体大量挥发。因此，如何在尽量减少现有水厂投资的情况下，减少恶臭气体的挥发，并且不影响现有工艺脱磷脱氮的效果，成为现今水处理研究的热点。研发出的一种新型的强化工艺全过程除臭技术得到快速的发展和应用，为解决上述问题提供了一条新的途径。全过程除臭技术起源于20世纪80年代，90年代该工艺在日韩等发达国家得到了广泛的应用和快速的发展。全过程除臭工艺运行实践表明，该工艺处理的污水厂臭气无明显臭味产生，污染物的去除，且污泥产率降低，使脱水性得到大幅提升。