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有害生物防制员要知道控制的有害生物属于哪一类，主要识别的依据是什么。要准确鉴定物种有很好的生物分类学的基础知识，特别是昆虫分类学的基础。对于有害生物防制员来讲，不要求系统地掌握生物分类学的基础理论，主要是根据一些外部形态特征、发生的环境等来判别是属于哪一类有害生物或是哪一种有害生物即可。
一般生物的分类，别叫做“界”，例如动物界。界下边是“门”，再下依次为“纲”“目”“科”“属”和“种”。例如，昆虫属于：动物界，节肢动物门，昆虫纲。昆虫纲的生物主要特征为：身体分为头、胸、腹3段，在胸上有3对足，一般具有2对翅(有些从表面上看退化为1对翅)和1对触角。蜱螨类具有4对足，身体一般分为2节，很容易与昆虫区分开来。鼠类有2对足，不是节肢动物，和昆虫、蜱螨类是完全不同的。

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已知的昆虫、鼠类、蜱螨类物种至少有一百万种以上，其中经济破坏严重的种类占的比例是很少的。有些有害生物对公共卫生影响很大，有些有害生物会损坏木材或建筑物，有些有害生物会影响人们的舒适度(如发出的噪声)。常见的有害生物的危害包括影响人类健康(叮、咬、传播疾病以及骚扰等)，减少或污染人类的食，干扰或破坏人类居住的
环境及其相关的建筑和水、电设施等。

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苍蝇类后翅膀化为用于飞行时掌握平衡的平衡棒；有些翅的质地发生了很大变化，例如一些甲虫前翅骨化程度很高，功能上是为了保护后翅；虱类、跳蚤等为了适应生活的环境，翅发生了退化。昆虫的口器为了适应不同的取食环境也进化出几种类型，如蛋的口器是一种典的用于咀嚼食物的称为咀嚼式口器；家蝇的口器主要是为了适应吸食物，称为舐吸式口器；蚊虫、虱类、蚤类的口器主要目的是为了吸血，称为刺吸式口器昆虫的足也发生了不同形式的进化，跳蚤的后足弹跳力很强，称为跳跃足。虱类的足粗短适于攀登，称为攀缘足。