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1.平衡肠道微生态

肠道内除了有益菌，还存在有害菌，它们能够引起蛋白质腐败，破坏肠道健康。不过，这些有害菌非常害怕酸性环境，而乳酸杆菌和双歧杆菌恰恰能够分解糖原，产生乳酸和醋酸，使肠道环境的pH值下降，进而抑制有害菌的生长，减少腐败物的产生，维持有害菌与有益菌的抗衡，达到平衡肠道微生态的作用。

2.改善腹泻和排便不畅

益生菌产生的乳酸和醋酸，能够促进肠胃的蠕动，同时，由于抑制了需氧菌和产碱细菌的生长（需氧菌往往会大量消耗消化物的水分，碱性不利于排泄物的水分保留），排泄物得以保持湿润，利于排便。另外，由于其它有害菌的生长也受到了抑制，肠道菌群平衡，所以，发生细菌性腹泻的机会也就大大减少。

提高机体抗氧化水平
机体中氧化物如氧自由基和羟基自由基等，含有未配对的电子，容易发生氧化还原反应，当机体中的氧化物过量时会导致机体产生氧化损伤。机体中存在着抗氧化系统，它们不断的清除机体合成的氧化物，维持着氧化物的动态平衡 [8] 。
抑制肠道炎症
益生菌可缓解机体的炎症反应 [9] 。
保护肠道粘膜屏障
益生菌可降低肠道粘膜渗透性，从而保护肠道粘膜屏障完整性 [8] 。
养殖水质调节
益生菌参与水体中的多种循环过程，通过自身的代谢，消耗水中的有机物质，减少水体中亚硝酸盐氮、氨氮的浓度，从而达到改善和维持良好水质的效果

益生菌补充方面，有以下人群需要积极补充：
1.力低下，容易罹患感冒和肠道疾病的人工喂养儿，早产儿、低体重儿、剖腹产儿等，他们需要补充益生菌促进肠道吸收，增加力 [10] 。
2.便秘和腹泻人群，益生菌能够促进肠道蠕动，增强肠道菌群平衡，从而有效治疗便秘和腹泻 [10] 。
3.消化不良的人群，以及肠道炎患者 [10] 。
4.肠道功能逐渐减弱的中老年人，肠道内双歧杆菌等益生菌因年龄减少，适当补充益生菌是有益的保健措施 [10] 。
5.先天性缺乏乳糖酶的人群，糖酶缺少或者因为乳糖不能被分解时会出现腹胀、腹泻，适当补充益生菌有良好作用 [10] 。
6.化疗或者放射治疗的肿瘤患者，因为益生菌容易被化疗药物杀死，从而出现肠道菌群失衡，因此化疗或者放疗者应该积极补充益生菌 [10] 。
7.肝硬化以及腹腔炎患者，益生菌可抑制肠内产胺的腐败菌，降低血中内毒素含量和降低肠内酸度，防治肠源性内毒素血症 [10] 。