1996—1998年省计委、省交通厅组织编制全省县乡公路规划
全省农村公路达到10.82万公里
部规划院是改革的产物。1998年3月10日，九届一次会议审议通过《关于机构改革方案的决定》，明确指出改革的原则是转变职能、政企分开。1998年4月，为加强的顶层设计和规划职能，交通部组建了部规划院。
“部规划院成立时的定位非常明确，从事公路公路生产厂家界桩和水运的发展战略研究和规划研究，为国家和行业服务，是部党组的智囊团。”部规划院首任院长庞俊达告诉记者，部规划院的成立要追溯到1989年的全国交通工作会，当时会上正式提出“三主一支持”交通基础设施建设长远规划，即建设公路主骨架、水运主通道、港站主枢纽和交通支持保障系统。在建设过程中，交通部愈发认识到规划的重要性，开始逐步筹备和酝酿成立立的规划研究部门。在1998年机构改革的契机下，部规划院应运而生。交通部从中交水运规划设计所和公路规划设计所负责战略规划的部门中，抽调80多名中青年技术骨干，组成了初的部规划院，下设公路、水运和安全三个所。
1998年的中国面临的不仅是改革，还有西部大开发战略、亚洲金融危机和如何在新世纪取得新成就等一系列挑战，我国开始实施积极的财政政策，以大规模的基础设施建设为核心拉动经济增长。
经济发展，交通，而交通需要规划，随着交通基础设施建设的大幕拉开，部规划院的诞生恰逢其时。从高速公路到农村公路，从港口到航道，再到水上安全保障，一个个关系国计民生和国家重大发展战略的规划陆续发布，交通的大骨架递次成型。
公路从线到网络畅出行
交通运输部历来重视规划，尤其在公路领域。早在1981年，原国家计委、经委和交通部联合颁布的《国家干线公路网（试行方案）》，划定了总规模约11万公里的普通国道；1992年发布的《国道主干线系统规划》，规划了12条总里程约3.5万公里的国道主干线。
随着经济的快速发展，以二、三级公路为主的国道网和“五纵七横”12条主干线不能满足需求。2001年，《国家高速公路网规划》被提上日程，经过三年的攻关，于2004年正式发布，这是部规划院成立后承担的个大型公路规划，也是我国个真正意义上的高速公路网规划。
“《国家高速公路网规划》次用全新的视角审视中国高速公路的未来发展，次用创新的规划方法布局我国高速公路网。”《国家高速公路网规划》项目负责人、部规划院原副院长关昌余介绍说，节点是《国家高速公路网规划》的核心，在这个规划中，全国大中城市被分为了39个重要节点、68个较重要节点和217个一般节点。这些节点按重要程度依次连接，形成了7条放射线、9条纵向路线和18条横向路线，并汇聚成中国高速公路网。这个路网连接了当时所有城镇人口超过20万的城市，覆盖全国10多亿人口，使我国80%的人口直接受益于高速公路，为贫困地区脱贫致富创造了条件。
随着《国家高速公路网规划》的颁布实施，我国高速公路发展步入了历史上快的时期。然而，我国经济社会的发展速度还是远远超过了《国家高速公路网规划》的预期。于是，规模更大的《国家公路网规划（2013年—2030年）》于2010年申请立项，并在2013年5月通过批准。
《国家公路网规划（2013年—2030年）》性地将普通国道和国家高速公路作为有机整体，纳入国家公路网进行统筹规划，除了连接所有超过20万人的中等及以上城市，还覆盖90%的城镇人口为15万到20万的小城市和80%的县市，实现大中城市30分钟上高速公路。
“表面上看，画上一根线很容易，其实每根线背后都是大量的现场查验和调研。”关昌余说，在编制《国家高速公路网规划》和《国家公路网规划（2013年—2030年）》过程中，他课题组基本走遍了中国所有的地级市，两个城市之间经济联系是否紧密，交通量有多大，修八车道还是四车道，闭上眼都能想起来。在建设墨脱公路时有9条线路可选，为了选择科学的路线，课题组用9辆车分9个方向勘察路况，结果110公里路走了14个小时，越野车颠掉了两个轮胎、扎坏了三个轮胎。
如果说干线公路是交通运输的主动脉，那么农村公路则是其中的毛细血管。截至目前，我国农村公路已达400万公里，从被忽视到成为备受关注的“四好农村路”，2005年发布的《农村公路建设规划》起到了关键作用。
“当时主要是国省和县乡道路，都没有村路的概念。农村公路的战略、规划、研究都是空白。”部规划院公路所副所长刘丽梅说，课题组在研究过程中发现，虽然规划的名字是建设规划，但农村公路面临的不仅是建设中的技术标准问题，更多的是哪出钱、谁来建和谁来养的机制体制问题，如果不把这些问题研究透，就很难把建设规划落实下去。为此，课题组把这个规划分为建设、供给理论、资金来源、管理养护等7个专题，系统研究农村公路的发展问题。针对谁是农村公路建设的责任主体、建设和养护资金从哪来、如何调动广大农民的积极性参与养护等疑难问题都提出了具体解决方案。
《农路公路建设规划》提出了“中央引导、地方为主、农村社区为辅”的农村公路建设新体制，刷新了全社会对农路公路建设的认识。地方意识到，建农村公路不仅是交通运输行业的事，也是不可推卸的责任，很多省出台了更细致的规划方案和实施细则，有的地方还设置了的农村公路处室。