水温机的在开机的时候，这个时候整个系统内部是没有任何媒介，需要把设定温度调低，再启动水泵让其自循环几分钟时间，让水温机把管路里面的空气充分排出并补水；有些客户在水温机正常加热之后会把冷却水塔和水温机链接的进水口或者出水口关闭，觉得这样会节省水源。其实，这样子做是完全错误的。进水口是后期的冷却和精度控温使用的，出水口是泻压用的。
对于模温机的阀门，可以根据模温机的使用温度选择，使用温度在常温-180之间的，建议选用进口品牌的球阀，密封件是聚四氟乙烯材质的，因为常规的球阀密封件耐不了这个温度，长期使用会导致阀门泄露。对于使用温度范围在常温-350度之间的，建议选用波纹管截止阀，波纹管截止阀的密封性好，可以长期耐350的高温不泄露。
由于间接冷却会使热量在热交换器中散失，当介质的实际温度与设定值偏差较大时，可以采用直接冷却方式，同时可使用电动阀或多段电磁阀控制以增加模温机的控制精度。直接冷却方式一般使用在封闭回路的水温机中。采用直接冷却方式可以大大提高系统的冷却能力，进而可将导热介质快速地降温。