堆肥发酵反应器是一种集原料收集、存贮及发酵功能为一体的好氧发酵装置，适用于对环境要求较高的养殖场、园林废弃物处理厂、厨余垃圾处理厂、城市污泥及垃圾处理厂、豆粕、木薯渣及米糠等好氧发酵饲料加工厂等对畜禽粪便、厨余垃圾、生活污泥等进行高温好氧发酵。结构紧凑，占地面积小，无需建设厂房，自动化程度高，节能环保。原料发酵后的成品从下方的出料口卸出，用做农业肥料、土壤改良、园林绿化等。
有机废弃物，包含人畜粪便、餐余垃圾、污水处理厂的副产品污泥、瓜果蔬菜市场废弃的烂瓜果烂菜叶等等，其年产量是同期工业固体废弃物产量的10倍，量大且集中，如不及时处理将带来严重的环境污染。对有机废弃物进行堆肥化处理(好氧发酵)可以实现废物的资源化利用，因此获得了广泛的应用，人们尝试着开发了众多的好氧发酵反应器，试图提高好氧发酵的效率，降低发酵设备的制造成本和运行成本。
农业有机废弃物包括农业生产产生的各类农作物秸秆，以及畜禽养殖产生的畜禽粪便等，处理难度较大，是环境治理的难题。将农业有机废弃物畜禽粪便、秸杆等作为可利用的资源进行好氧发酵 ，不仅可以解决农业生产废物对环境的污染问题，同时生产出来的有机肥可以带来收益，实现了废弃物的无害化、减量化、资源化，符合我国对环境保护和资源可持续利用的政策方针。
菌肥的使用方法：
1. 施用量：一般情况下，每亩土地使用菌肥的量为10-15公斤。
2. 施用时间：菌肥可与基肥一同施用，也可作为追肥使用。一般在种植前2-3周施用，或者在植物生长期间按需追肥。
3. 施用方式：菌肥可直接撒在土壤表面，然后轻轻耕入土中，也可与底肥或追肥混合使用。
需要注意的是，菌肥的保存要避免阳光直射和高温环境，尽量保存在阴凉干燥处。此外，在施用菌肥时，应避免与农药等化学物质混用，以免发生不良反应。
微生物菌肥集生物菌、中草药、矿物质三效合一，从二十余味中草药及海藻中发酵出的多糖类、生物碱类、类、腐殖酸类、海藻素等生物活性成分，为作物补充高能量物质及功能性物质，能够开启并促进植物次生代谢。
微生物代谢物有直接杀菌的作用且进入土壤会在根际定殖，抢占生态位点让线虫及真无法侵染。有益微生物进入土壤会在根系周围产生大量粘多糖与植物分泌的粘液及矿物胶体、有机交替相结合，形成土壤团粒结构，提高土壤蓄肥、保水能