低氮冷凝燃气锅炉的运行操作及注意事项：
对新安装投入使用或长期停用恢复使用的低氮冷凝锅炉，启动前要做好锅炉和管网的冲洗工作；要全系统内的污垢铁绣和其它杂物。
启动天然气锅炉要先开启循环水泵才能点火或停炉后的重新点火。
运行中应保持天然气锅炉压力稳定，严格监视温度变化，经常排掉管网内的气体，防止炉水汽化，控制管网水的流失，定期排污，合理地分配水量等。
低氮冷凝锅炉压力的突然升高一般是因水温过高汽化造成，也可能因突然停泵或管内严重积垢、杂物堵塞。锅炉压力突然降低，一般是天然气锅炉缺水造成，可能是排污阀没关严或管网泄露，发现后应及时补水。
低氮冷凝锅炉运行中应严格控制出水和回水温差，不要超过30℃，否则因温差变化大，对天然气锅炉的安全运行带来很大危害。
定期排污（每班至少一次）应认真进行，避免污垢在锅内堆积造成锅筒鼓包或管子堵塞爆管。
正面影响
燃料燃烧会产生大量的CO2、NOX和少量的SO2，这些物质排放到大气，会引起温室效应和酸雨的产生，对环境产生破坏作用。冷凝锅炉在冷凝烟气中水蒸汽的同时，可以方便地去除烟气中的这些有害物质，因此，采用冷凝锅炉对保护环境也具有重要的意义。
负面影响
由于冷凝的作用排烟温度过低，如果低于临界点会产生冷凝水，从而产生酸性排放物，对锅炉换热体产生腐蚀，因此要控制排烟温度。