南昌公司进出口权的办理部门与顺序如下：
确定公司经营范围是否含有进出口权业务，如没有，需先到工商局变更公司经营范围，添加进出口权业务，办理时间为3-5个工作日
然后到外经贸委办理备案登记，领取《对外贸易经营者备案登记表》，领取到备案表后，携公司营业执照副本原件、，及相关表格到海关备案；备案成功后3-5个工作日领取《进出口收发货人报关注册登记证书》；领书后办理中国企业电子口岸IC卡，会领取到法人IC卡一张、操作人IC卡一张、海关读卡器一个、系统光盘一个，以上材料需支付工本费；然后到检验检疫局办理《自理报检单位备案登记证明书》；后到国家外汇管理局江西省分局进行备案
南昌企业进出口权办理，在资料的情况下，需要10-15个工作日左右。