食品厂房装修为防止室内外温差而产生结露，室内不同洁净度的房间之间的门窗缝隙要密封。门窗材料应选择耐侯性好，自然变形小，制造误差小，气密性好的，造型要简单，不易积尘，便于清扫，不设门槛。洁净厂房的门窗宜用金属或金属涂塑材料，不得使用木门窗，以免长期受潮长菌。外墙上的窗宜与内墙面平整，窗台呈斜角或不留窗台，且为双层固定窗以减少能量损失。
食品厂房装修洁净厂房的建筑布局上一般在厂房外设置一环形密封通道。它使洁净区与外界有了一个缓冲地带。能够防止外界污染同时也相对节能。厂房内门窗宜于内墙面平整，不设置窗台。外窗的层数设置和结构形式要充分考虑对空气水分的密封，使污染粒子不易从外部渗入。
工厂装修要考虑的是地面部分，一般的工厂装修地面是不需要承载负荷的，那么就可以考虑用一些物美的装饰材料，比如地板砖或者复合木地板等来做厂房地面装修材料，有的工厂装修时要考虑防静电，那么就要选择防静电地板或防环氧地坪等来做为工厂装修地面的材料，还有的工厂装修时需要地面承载负荷，那么就要在地面基层做混凝土，混凝土分为商业混凝土和土做法混凝土两种，前者造价略高但质量稳定，后者价格较低质量一般，然后在混凝土基层上再铺设其他质地比较坚硬的石材做饰面即可。
工厂装修时还要注意的是顶部，厂房的顶部通常较高，且大多数都是钢结构框架，在装修顶部时先要设计消防、通风、及中央空调的合理安排，因为这些都是工厂装修中必要的硬件设施，尤其是消防。接下来就是根据使用的要求来确定是否吊顶的问题了，工厂吊顶的材料很多，如果为了美观些可以用矿棉吸音板、石膏板、铝塑板等材料来为顶部做装饰，还可以不做任何吊顶，把顶部需要隐藏的或者不美观的一些设施做局部的修饰也是一种现代的、简约主义设计。
厂房的缔造围护构造和室内装修，应选用气密性，且在温度和湿度等改变作用下变形小的资料。墙面内装修当附加构造骨架和保温层时。应选用非平息体或难平息体。
洁净室和人员污染用室设置的外窗，应选用双层玻璃金属窗，并应有的气密性。洁净室内的密闭门宜朝空气洁净度较高的房间翻开。无窗洁净室的密闭门上宜设观察窗。洁净室门窗、墙面、顶棚、地（楼）面的构造和施工缝隙，均应采纳牢靠的密封办法。洁净室内的色彩宜浓艳柔软。